La manera más fácil de hacer booteable una memoria USB es utilizando un programa totalmente portable el cual se encarga de crear con la mayoría de los Sistemas Operativos tanto Linux como la versión que tengamos de Windows logrando asi tener una memoria completamente booteable en unos simples pasos sin necesidad de instalar nada .
Descargar y ejecutar el programa ( soportado para todos los Windows )
http://olaurl.com/universal-usb
Recuerda guardar todo lo que haya dentro del USB en otra ubicación para no perder todos los datos durante el proceso.
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Fuente: www.taringa.net